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Chargé de développement de workflows Bioinformatiques - Omics & Digital Pathology H/F posté par PIERRE FABRE

Intern
Midi-Pyrénées

Description de l'offre



Branche

Pharmaceutique



Société

INSTITUT DE RECHERCHE PIERRE FABRE SAS



Description du poste

Emploi

Système d'information (SI) - Chef de projet SI



Intitulé du poste

Chargé de développement de workflows Bioinformatiques - Omics & Digital Pathology H/F



Contrat

Stage



Durée du contrat

6



Taux d'activité

Temps plein



Mission

Dans un contexte pharmaceutique, au sein de la plateforme Médecine Translationnelle et rattaché au Responsable de la Bioinformatique , vous participez au déploiement d'un workflow d'analyses bioinformatiques permettant la convergence entre les données issues d'essais cliniques, d'analyses RNASeq/Single Cell et des données d'imagerie, dans un but de découverte/confirmation de nouvelles cibles thérapeutiques.

Plus précisément, vous :

- Assurez la réconciliation des différentes sources de données ;
- Assurez l'intégration de ces données dans une plateforme d'analyses in silico ;
- Développez des workflows d'analyse pour comparer les résultats RNASeq et Single Cell, puis Omics Vs Imagerie, en collaboration avec les Responsables Omics et Digital Pathology de la Plateforme ;
- Effectuez des analyses de cibles thérapeutiques en collaboration avec un Data Scientist ;
- Générez le Reporting approprié à l'aide de l'outil de reporting Spotfire à destination des métiers.



Profil

De formation type Master 2 specialisation Bioinformatique / Médecine Translationnelle, vous êtes à la recherche d'un stage de fin d'études

Vous avez des connaissances en langages  Python, R+Bioconductor

Vous détenez des connaissances en Bases de données / Data Management / Statistiques

Des Connaissances en Immuno Oncologie et Machine Learning/Deep Learning seraient un plus

Vous êtes autonome, rigoureux et motivé

Vous savez travailler en équipe

Vous êtes doté d'un bon relationnel

Vous avez le sens du résultat

Numéro de référence

2020-7824

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